Протеогеномное профилирование выявляет новые терапевтические мишени для рака молочной железы

К такому выводу пришли ученые из Соединенных Штатов Америки после серии обширных работ.

Недавние достижения в области масс-спектрометрии позволили провести обширный анализ протеомов рака. Благодаря этой методике у исследователей появилась беспрецедентная возможность профилировать антитело-независимый протеом 80 % всех белков основных тканей человека. 

Анализ глобального протеома в тандеме с геномным профилированием дал ключевое представление о молекулярной этиологии колоректального рака, рака молочной железы и яичников. 

Предыдущие исследования опухолей молочной железы человека идентифицировали повышенную экспрессию фосфорилированных киназ. Однако в этом анализе не рассматривались первоначальные терапевтические гипотезы. Кроме того, лечение было неоднородным, и установить связь между ним и протеогеномными данными было очень трудно.

В данной работе исследователи из США попытались установить, может ли протеогеномный подход помочь в идентификации прогностических биомаркеров и создании эффективных терапевтических стратегий. С этой целью они проанализировали 12 794 белка и 56 874 сайта фосфорилирования. В исследовании рассмотрели 24 типа рака молочной железы. После первичной фильтрации 10 069 белков и 36 609 участков фосфорилирования были отобраны для последующих работ.

Ученые выявили уникальное количество значимых белковых и фосфопротеиновых событий. Аналогичные события имели место в образцах рака молочной железы пациентов, что указывает на их клиническую значимость. На некоторых моделях авторы подтвердили эффективность целевых противоопухолевых препаратов.

Таким образом, протеогеномное профилирование имеет огромный потенциал для разработки индивидуализированных подходов к лечению рака.